Ementas de Disciplinas oferecidas pela Pós-Graduação em Biofísica

ABORDAGENS HISTOLOGICAS DA RETINA - 90 horas
Patricia Franca Gardino

Ementa: Trata-se de um curso eminentemente prático, mas que também aborda aspectos teóricos da metodologia usada rotineiramente no laboratório de Neurobiologia da Retina.  O aluno pode usar em seu modelo de tese estas técnicas para visualizar marcadores celulares (glia/neurônio), enzimas de síntese para neurotransmissores, receptores de membrana, proteínas de citoesqueleto, entre outros.  Estudará através da histoquímica enzimática o estado de ativação de enzimas; e algumas colorações de rotina para o tecido retiniano.   Cada aluno trará seu problema metodológico para tentar ser respondido por algumas destas técnicas.

ACADEMIC WRITING FOR AN INTERNATIONAL SCIENCE - 30 horas
Edson Rondinelli

Lecture 1: Introduction. Story telling and Story content;
Lecture 2: Story structure; Writing for the public; IMRAD; Tables and Figures; Results and Methods;
Lecture 3: Introduction; Discussion; Abstract; Title; Key words; Plagiarism and Paraphrasing;
Lecture 4 : Story language I;
Lecture 5: Story language II;
Lecture 6: Condensing; Grammar tips; Revising first draft; Final version;  Submission and Peer review;
Lecture 7: Posters: preparing, revising and presenting a Poster.

ASPECTOS EVOLUTIVOS E MOLECULARES DE CIANOBACTÉRIAS - 30 horas
Sandra M.F. de Oliveira e Azevedo

Ementa: Aspectos evolutivos e adaptativos de cianobactérias: origem, filogenia e diversidade. Serão abordados os avanços do conhecimento em aspectos evolutivos do grupo das cianobactérias, os processos adaptativos que permitiram ao grupo colonizar diferentes habitats, a diversidade metabólica e molecular incluído a discussão sobre estudos genônimos, proteômicos e metagenômicos. Serão também abordadas as hipóteses sobre a produção de toxinas e outros metabólitos secundários, incluindo a comunicação celular intra e interespecífica.

AVALIAÇÃO DA CONTAMINAÇÃO AMBIENTAL E HUMANA POR METAIS PESADOS - 30 horas
Olaf Malm

Ementa: Ciclo Geral de Metais; Metais Pesados, toxicidade; Emissões naturais e antropogênicas: Origem e quantificação relativa. Usos Industriais. Formas dos metais no meio ambiente. Lançamentos e transformações. Metais dissolvidos ou associados a partículas. O que é disponível biologicamente? Incorporação biológica. Acumulação e biomagnificação. Transformações nos organismos. Homem. Tempo de residência. Efeitos tóxicos. Monitoração. Utilização de traçadores radioativos e isótopos estáveis em ciências ambientais, possibilidades e limitações. Estudos de casos. Rio Paraíba do Sul - Rio Guandu: Cádmio no Rio Paraibuna. Amazônia; Minamata; Toyama. Seminários. Teste de percepção de risco de câncer para diferentes agentes tóxicos.

BASES BIOQUÍMICAS DA NEUROTRANSMISSÃO SINÁPTICA - 120 horas
Fernando Garcia de Mello

Ementa: Síntese e degradação de GABA no SNC. Descarboxilase do ácido glutâmico (GAD). Receptores Gabaérgicos; localização do sistema Gaba no SNC; liberação sináptica; efeito de drogas; implicações fisiológicas e patológicas dependentes de Gaba. Técnicas para estudo do sistema Gabaérgico. Síntese e degradação de catecolaminas; enzimas envolvidas no metabolismo de catecolaminas; receptores dopaminérgicos, participação do AMPc na modulação dopaminérgica; localização do sistema dopaminérgico no SNC; liberação sináptica, efeito de drogas; implicações fisiológicas e patológicas dependente de dopamina. Técnicas para o estudo do sistema dopaminérgico. Síntese e degradação da acetilcolina; receptores nicotínicos e muscarínicos; localização do sistema colinérgico no SNC; liberação sináptica. Aminoácidos excitatórios e neurotoxicidade; papel em disfunções do SNC. Modelos de estudo: retina de aves, cultura de células e de  tecido nervoso. 

BASES MOLECULARES DA PROGRESSÃO TUMORAL - 60 horas
Bruno Lourenço Diaz

Ementa: O curso abordará aspectos envolvidos no desenvolvimento tumoral incluindo as capacidades adquiridas pela célula tumoral como: auto-suficiência de fatores de crescimento: potencial ilimitado de replicação; resistência à apoptose; insensibilidade à sinais de parada do crescimento: invasividade; potencial metastático aumentado; indução da formação de novos vasos; e alterações no metabolismo celular. Também serão apresentados os avanços recentes nos estudos de oncogenes; genes supressores de tumor; transição epitélio-mesenquimal; imunologia tumoral e micro-ambiente tumoral. Os alunos deverão apresentar seminários sobre os temas do curso e participar como tutores de alunos de graduação estudando os mesmos assuntos.

BIOESTATÍSTICA I - 90 horas
Gilberto Weissmuller

Ementa: Introdução. Dados biológicos. Levantamento de dados e técnicas de amostragem. Estatística descritiva. Noções de probabilidade.  Distribuição normal. Estatística inferencial. Teste do Qui-quadrado (x2). Distribuição do t-Student. Análises de Variância: conceituação básica. Testes não paramétricos. Análise de regressão e correlação.

BIOÉTICA, BIOSSEGURANÇA E BOAS PRÁTICAS COM ANIMAIS EM EXPERIMENTAÇÃO - 30 horas
Marcelo Marcos Morales

Ementa: 

Bioética: Histórico das diretrizes de ética internacional e nacional. Conceitos gerais de ética, ética em pesquisa com uso de animais.

Biossegurança: Conceitos, histórico e situação da biossegurança no Brasil. Classes de risco dos organismos biológicos; níveis de biossegurança. Equipamentos de proteção individual e coletivo. Boas práticas de laboratório. Risco químico. Risco radioativo. Padrão de procedimentos operacionais. Mapa de risco. Desinfecção e esterilização. Plano de gerenciamento de descarte de resíducos. Plano de emergência de medidas de contigência. Prevenção de incêndio.

BIOFÍSICA ESPECIAL I - 15 horas
Coordenador do Curso de Graduação

Ementa: Tópicos atuais em Biofísica

BIOFÍSICA ESPECIAL II - 30 horas
Coordenador do Curso de Graduação

Ementa: Tópicos atuais em Biofísica

BIOFÍSICA ESPECIAL III - 45 horas
Coordenador do Curso de Graduação

Ementa: Tópicos atuais em Biofísica

BIOLOGIA DE FLAVIVÍRUS I - 45 horas
Ronaldo da Silva Mohana Borges

Ementa: Aspectos gerais das flaviviroses; epidemiologia; estrutura viral; replicação e montagem; conceitos moleculares e estruturais das proteínas dos flavivírus; imunidade inata e infecção por flavivírus; resposta do hospedeiro durante infecção; diagnóstico; vacinas anti-flavivírus; interação vetor-vírus; vetores de flavivírus e estratégia para seu controle.

BIOLOGIA DE FLAVIVÍRUS II - 45 horas
Ronaldo da Silva Mohana Borges

Ementa: Curso experimental; titulação viral; cultivo de célula e infecção por dengue; PRNT; ensaio de atividade enzimática da NS3; diagnóstico sorológico; diagnóstico molecular por PCR em tempo real.

BIOLOGIA DE PROTOZOÁRIOS - 90 horas
Rossiane Claudia Vommaro

Ementa: Aulas teóricas, práticas e seminários sobre os seguintes protozoários: Trypanosoma cruzi, Leishmania, Trypanosoma brucei, Toxoplasma gondii, Plasmodium, Trichomonas vaginalis, Giardia lamblia, Entamoeba histolytica. Aspectos biológicos, interação com a célula hospedeira e mecanismos de escape.

BIOLOGIA MOLECULAR I - 60 horas
Turan Peter Urmenyi

Ementa: DNA; recombinação gênica; RNA; biossíntese de proteínas; regulação da expressão gênica em bactérias; o cromossomo eucariótico; organização gênica; regulação da expressão gênica em eucariotos e modelos e mecanismos de enovelamento proteico e transporte de proteínas na célula modulados por chaperoninas.

CÉLULAS GLIAIS - 45 horas
Leny Alves Cavalcante

Ementa: 

1. Biologia básica da macroglia (incluindo células ependimárias) e microglia;
2. Biologia básica de células tipo radial (Mueller, Bergmann, tanicitos);
3. Biologia básica da glia embainhante olfatória e células de Schwann;
4. Glia e barreira hemato-encefálica;
5. Glia e modulação do meio extra-celular;
6. Glia na depressão alastrante e na anoxia;
7. Papel da glia na injúria e na regeneração neural;
8. Glia como parte do sistema imune;
9. Interações glio-parasitárias;
10. Glia em doenças degenerativas. Glioma.

CINTILAÇÃO LÍQUIDA, ESPECTROSCOPIA GAMA E PROTEÇÃO RADIOLÓGICA - 45 horas
Jean Remy Davée Guimarães

Ementa: Fundamentos teóricos, meios cintiladores, detetores, extinção, análise de espectros simples e compostos, identificação e quantificação de isótopos em mistura, tratamento de dados e apresentação de resultados. Estatística de contagens. Princípios básicos de Proteção Radiológica na manipulação de isótopos radioativos.

CITOTOXICIDADE MEDIADA POR CÉLULAS - 60 horas
Pedro Muanis Persechini, Vivian Mary Barral Dodd Rumjanek

Ementa: Parte teórica: caracterização de diversas sub-populações de células citolíticas com especial atenção aos linfócitos T e às células "Natural Killer"; mecanismos de reconhecimento e ligação alvo-efetor; moléculas envolvidas na citotoxicidade celular e seu mecanismo de ação; morte celular programada e apoptose; tópicos avançados em citotoxicidade e revisão da literatura recente. Parte prática: ensaios de citotoxicidade.

CULTURA DE TECIDOS ANIMAIS E BIOLOGIA TECIDUAL - 90 horas
Antonio Carlos Campos de Carvalho, Regina Coeli dos Santos Goldenberg

Ementa: História e objetivos da bioengenharia tecidual. As bases do crescimento e diferenciação celulares. Desenvolvimento tecidual in vitro. Células-tronco. Transplante de células e tecidos. Biomateriais na engenharia tecidual. Técnicas de microscopia avançada.

DEZ LIVROS PARA LER ANTES DO PhD - 60 horas
Mauro de Freitas Rebelo

Ementa: História e filosofia da ciência, método científico. Biografias de pesquisadores famosos.

DIDÁTICA EM BIOFÍSICA E FISIOLOGIA I - 15 horas
Coordenador do Curso de Graduação

Ementa: Determinação de objetivos educacionais, desenvolvimento de performance mínima aceitável, estratégia educacional, planejamento curricular, tática educacional. Métodos e técnicas de instrução, construção de testes de avaliação, interpretação de resultados de testes de avaliação, planejamento de pesquisas educacionais. (Treinamento para aulas. Tutoria). Para alunos de Mestrado.

DIDÁTICA EM BIOFÍSICA E FISIOLOGIA II - 30 horas
Coordenador do Curso de Graduação

Ementa: Determinação de objetivos educacionais, desenvolvimento de performance mínima aceitável, estratégia educacional, planejamento curricular, tática educacional. Métodos e  técnicas de instrução, construção e testes de avaliação, interpretação de resultados de testes de avaliação, planejamento de pesquisas educacionais. (aulas de graduação). Para alunos de Doutorado.

ECOTOXICOLOGIA AQUÁTICA - 30 horas
Valéria Freitas de Magalhães

Ementa: Introdução a toxicologia: Definições poluentes e contaminantes e inter-relações dos contaminantes entre os diversos compartimentos do meio ambiente. Origem da contaminação ambiental. Destino dos contaminantes nos ecossistemas aquáticos e nos organismos. Tipos de produtos tóxicos: Xenobióticos e toxinas (com ênfase as cianotoxinas). Interação de poluentes ou biotoxinas com a biota: bioconcentração, biacumulação, biomagnificação, biotransformação, biodegradação, detoxificação e eliminação. Organismos como indicadores de qualidade ambiental: bioindicadores, biomoniotores e biom]arcadores. Classificação dos efeitos tóxicos. Vias de entrada de produtos tóxicos. Biomonitoramento. Testes de toxicidade com organismos aquáticos. Introdução a avaliação de risco ecológico e para populações humanas.

ESCOLA DE ALTOS ESTUDOS EM BIOPROTISTAS - 75 horas
Narcisa Leal da Cunha e Silva

Ementa: Teoria e aplicação de diversas técnicas e métodos de Microscopia Óptica e Eletrônica aplicados ao estudo da Biologia Celular de Protistas: Microscopia Óptica: Princípios básicos. Microscopia óptica: Contraste de Fase e Contraste Interferencial. Microscopia de Fluorescência. Microscopia confocal e multi-fotônica. Microscopia Óptica de alta resolução. Microscopia de Força Atômica. Introdução à Microscopia Eletrônica de Transmissão. Introdução à Microscopia Eletrônica de Varredura. Criomicroscopia. Reconstrução Tridimensional. Citoquímica e Imunocitoquímica. Microanálise. Confocal Microscopy for Cellular Microbiology Studies of Bacterial Toxins. urvival and Death in the Third Dimension. Improved Sensitivity by using a Spectral GaAsP Array Detector for Fluorescence Detection in Confocal Imaging at the Zeiss LSM 780. Long and Short Distance Protein Sharing in the Immune System. Second Harmonic Microscopy. Species-Selective Nanoscale Imaging in fixed and living cells. SIM, dSTORM and PAL-M: Three Ways to Outsmart Diffraction Limits. Four-Dimensional Cryo Electron Microscopy at Atomic Resolution. Cryo-EM Studies of Nascent Polypeptide Chains on the Ribosome.  Characterization of an Essential Motile Process of Toxoplasma for Cell Invasion : Conoid Extrusion. Imaging the endo-lysosomal system by ‘correlative live cell - electron microscopy' (CLEM) and ‘section light electron microscopy' (SLEM). The use of High Pressure Freezing in Correlative Light Electron Microscopy. Event Streamed Spectrum Imaging in Biological Electron Probe X-ray Microanalysis. Imaging Trace Metals in Life and Disease with X-Ray Fluorescence Microscopy. Advances in Biological Microanalysis Using EFTEM and EELS. Structural bases of force transmission during directed cell migration. TEM Tomography for Thick Biological Specimens. 3 Dimensional Microscopy, Large Volume Serial Block Face Imaging in the SEM. Template matching as a tool to analyze electron tomograms. Towards Visualization of Nanomachines in their Native Cellular Environment. Electron Microscopy and Spectroscopy in Four Dimensions. Far-Field Optical Nanoscopy. Growth and Aging of Nanomorphologies. 

ESPECTROMETRIA DE ABSORÇÃO ATÔMICA: PRINCÍPIOS E USO ECOTOXICOLÓGICO DA TÉCNICA - 60 horas
Paulo Renato Dorneles

Ementa: Histórico e fundamentos da espectrometria de absorção atômica (AAS);  as técnicas de atomização (FAAS, HGAAS, CVAAS, GFAAS); garantia de  qualidade / controle de qualidade na determinação de elementos-traço;  cuidados na coleta e armazenagem de amostras; limites de detecção;  curvas de calibração; adição de analito; soluções-branco;  interferências espectrais e não espectrais; corretores de fundo  (contínuo; Zeeman); material certificado de referência (CRM) e padrão  interno; informações ecotoxicológicas obtidas por AAS (a determinação  de elementos-traço como ferramenta auxiliar em estudos de ecologia  alimentar); o uso da AAS para avaliação da exposição de organismos a  compostos organometálicos.

ÉTICA E INTEGRIDADE NA PESQUISA CIENTIFICA E TECNOLÓGICA - 45 horas
Adalberto Ramon Vieyra, Martha Meriwether Sorenson, Sonia Vasconcelos

Ementa: A moral e a ética. Ética em ciência & Tecnologia. Integridade em Pesquisa. A má conduta na ciência. A fabricação, a falsificação e o plágio (FFP). Práticas questionáveis em pesquisa. “The Singapore Statement”. Ética em publicações científicas. O plágio científico e a paráfrase. Práticas lingüísticas questionáveis na comunicação científica. “Retractions” na ciência. Autoria intelectual e responsabilidade autoral.

EVOLUÇÃO DO SISTEMA IMUNITÁRIO - 30 horas
André Macedo Vale

Ementa: Evidências indicam a presença de um sistema imune rudimentar em organismos invertebrados. Tais achados sugerem que o sistema imune de mamíferos tenha evoluído a partir de ancestrais. Elementos da imunidade inata presentes em organismos primitivos persistem nos vertebrados e estão envolvidos na evolução da imunidade adaptativa. Assim, a disciplina tem como objetivo estudar a origem e evolução do sistema imune em mamíferos através da comparação dos componentes da resposta imune inata e adaptativa encontrados em invertebrados e vertebrados.

EXPRESSÃO GÊNICA E METAGENÔMICA - 120 horas
Débora Souza Faffe, Rosane Silva, Turan Peter Urmenyi

Ementa: 

(a) Genômica e Metagenômica. Padrões globais de expressão gênica: Transcriptômica e Proteômica. Aplicações de Bioinformática: Manipulação computacional de seqüências gênicas, análise filogenética. 
(b) Mecanismos de regulação gênica. Estudo de sequências reguladoras por ensaio de transfecção com gene repórter. Ensaios quantitativos de expressão de mRNAs especifícos por RT-PCR em tempo real

FILOSOFIA E HISTÓRIA DA CIÊNCIA - 15 horas
Maria Cristina Machado Motta

Ementa: Neste curso, nós empregaremos a perspectiva metodológica defendida pelos Science Studies, “Estudos Sociais de Ciência e Tecnologia”.  O que é história da ciência? (as relações da história da ciência com a história); O que é filosofia da ciência? (as relações da filosofia da ciência com a filosofia); A pergunta: “o que é a ciência?”; O que são os Science Studies? Por que investigar a ciência a partir das perspectivas da filosofia e da história? (Augusto, Fernando & Cristina). Uma breve história da filosofia da ciência (I): a profissionalização do cientista no século XIX – os dilemas da profissionalização da atividade de pesquisa; a produção filosófica dos cientistas; um estudo de caso: os físicos na passagem do século XIX para o século XX. (Augusto, Leonardo & Cristina). Uma breve história da filosofia da ciência (II) - A filosofia da ciência no século XX: o exemplo de Kuhn no quinquagésimo aniversário da publicação da Estrutura das Revoluções Científicas (André & Cristina). Science studies, prática científica, controvérsias científicas: o início da física moderna no Brasil (Augusto,  André & Cristina). A questão do ethos na ciência - dois exemplos: Ciência pós-acadêmica e o sistema biomédico de investigação (Verusca & Cristina). Objetividade e verdade: virtudes epistêmicas ou critérios epistemológicos? (Fernando, Augusto, Cristina & Priscila). Ciência, Técnica e Metafísica – Heidegger, Heisenberg, Discussão geral (Fernando, Juliana, Cristina & Augusto)

FÍSICO-QUÍMICA I - 90 horas
Paulo Mascarello Bisch

Ementa: Leis da termodinâmica: energia e entropia. Potenciais termodinâmicos: energia livre. Teoria cinética dos gases. Soluções diluídas: potenciais químicos e eletroquímicos. Reações químicas: equilíbrio químico. Equilíbrio Associação-Dissociação: pH. Equilíbrio eletroquímico: potenciais de membranas, Interações hidrofóbicas-hidrofílicas: agregados moleculares. Processos de transporte: difusão, viscosidade. Transporte através de membranas.

FUNDAMENTOS BIOFÍSICOS NO ESTUDO DE MACROMOLÉCULAS - 45 horas
Jennifer Lowe

Ementa: Métodos biofísicos de estudo das soluções (osmometria, pHmetro, diálise, espectrofotometria e fluorimetria). Métodos biofísicos no estudo de macromoléculas: precipitação “salting-out”, “salting-in”, ultracentrifugação, eletroforese, isoeletrofocalização e eletroforese bidimensional, cromatografia de camada fina, cromatografia em coluna, métodos de detecção de macromoléculas.

FUNDAMENTOS BIOQUÍMICOS SOBRE A TRANSIÇÃO EPITÉLIO-MESENQUIMAL NO DESENVOLVIMENTO EMBRIONÁRIO E EM DOENÇAS - 45 horas
Christina Maeda Takiya, José Osvaldo Previato, Leonardo Freire de Lima, Lucia Mendonça Previato

Ementa: A transição epitélio-mesenquimal (TEM) é um fenômeno natural que ocorre durante a organogênese e morfogênese. Entretanto, a reativação das vias moleculares associadas à TEM também estão relacionadas a processos patológicos como a fibrose e a progressão do câncer (Fig. 1). Alterações no padrão de indução da TEM incluem o comprometimento da aderência célula-célula devido à redução da expressão da Ecaderina, associado ao aumento da expressão dos marcadores mesenquimais (N-caderina, vimentina, citoqueratinas e fibronectinas). Esse processo também pode ser caracterizado pela produção de metaloproteínases enzimas zinco dependentes capazes de degradar todos os componentes da matriz extracelular. A TEM é o ápice de uma série de eventos bioquímicos que levam a mudanças celulares, reversíveis ou não, em resposta a estímulos extracelulares. Hoje, o número de trabalhos relacionados a esse tema tem crescido exponencialmente, e o estudo dos mecanismos moleculares que governam a ativação e/ou a reativação desse processo vem contribuindo para a identificação de enzimas e suas vias metabólicas, que poderão atuar como alvos moleculares promissores no combate a diferentes doenças. Esta disciplina tem como principais objetivos: (i) discutir a participação da TEM no desenvolvimento embrionário e na doença; (ii) abordar os mecanismos moleculares associados a esse processo (iii) e entender como distúrbios metabólicos podem modular a reativação das vias moleculares associadas a TEM em condições patológicas. No decorrer do curso, os alunos terão que apresentar um seminário sobre pelo menos um tema discutido durante o curso, e redigir uma mini-revisão, conceituando de maneira objetiva os tópicos abordados nos seminários apresentados.

FUNDAMENTOS DE BIOLOGIA CELULAR - 90 horas
Marcia Attias, Narcisa Leal da Cunha e Silva

Ementa: Membranas biológicas: estrutura e composição; fluidez de membranas; transporte através de membranas; receptores; sinalização celular; junções intercelulares; matriz extracelular; citoesqueleto; mitocondria; cloroplasto; peroxisomo; hidrogenosomo; retículo endoplasmático; complexo Golgi; e endocitose.

FUNDAMENTOS EM MICROSCOPIA CONFOCAL: DA TEORIA À PRÁTICA - 45 horas
Marcelo Felippe Santiago

Ementa: O microscópio confocal: Componentes e funcionalidade do “hardware” (laser, fibra óptica, “framegraber”, fotodetectores, fotomultiplicadores e outros componentes). Aspectos ópticos e mecânicos. Princípio da microscopia de varredura por laser. Caminho óptico, espelhos dicróicos (HFT e NFT) e filtros (LP e BP). Resolução ó´ptica e digital. Preparação de amostras: corantes fluorescentes utilizados em microscopia confocal e meios de montagem. Aquisição de imagens: “single track”, “multitrack” ou “lambda mode”. Geração de imagens em 2D, 3D ou 4D (imagens convencionais, em pilhas ou videomicroscopia). Preparação e apresentação de imagens em 3D: galeria, projeção, animação rotatória, imagens estereográficas, projeção “color-coded height”, secções ortogonais e secções obliquas. Utilização do microscópio confocal como ferramenta: FRET, FRAP e FLIP.

IMUNOBIOFÍSICA - 60 horas
Pedro Muanis Persechini

Ementa: Parte teórica: conceitos básicos de imunologia celular; conceitos básicos de canais iônicos, receptores e transdução de sinal; canais iônicos de linfócitos, fagócitos mononucleares e outros leucócitos; o papel fisiológico destes canais; transporte e controle das concentrações iônicas e de pH em leucócitos; proteínas formadoras de poro no sistema imune; receptores de nucleotídeos (P2) e seu papel no sistema imune. Tópicos avançados em imunobiofísica e revisão da literatura recente. Parte prática: detecção de correntes iônicas em células do sistema imunológico.

IMUNOLOGIA - 90 horas
Bruno Lourenço Diaz, Robson Coutinho Silva

Ementa: Fisiologia do sistema imune. Bases moleculares do sistema imunológico. Ativação e função linfocitária. Imunidade celular. Tolerância imunológica. Mecanismos imunológicos em processos patológicos. Autoimunidade. Alergia e inflamação. Mecanismos imunológicos de defesa à doenças infecciosas e vacinação, influenza (vírus), tuberculose/lepra (mycobacteria). Imunologia do câncer e imunoterapia.

 

IMUNOLOGIA FUNDAMENTAL - 45 horas
Ana Carolina Oliveira, Leonardo Holanda Travassos Correa

Ementa: Fisiologia do sistema imune: ontogenia de células e órgãos do sistema linfóide, diferenciação linfocitária, tráfico linfocitário, moléculas de adesão. Bases moleculares do sistema imunológico: teoria de seleção cl onal, estrutura de imunoglobulinas, bases molecular da especificidade de ligação; base genética da diversidade de imunoglobulinas, complementaridade idiotípio (network), estrutura e genética dos TCR's, MHC: estrutura, organização gênica, polimorfismo genético, base estrutural do reconhecimento dos antígenos de classe I/II; mecanismos de processamento antigênico. Ativação e função linfocitária: interleucinas, principais marcadores fenotípicos de linfócitos, funções associadas com os marcadores CD4+ (Th1/Th2), CD8+ NK, regulação de receptores para citoquinas, ativação linfócitária, apoptosis. Imunidade celular: ativação de sistema microbicidas em macrófagos; mecanismo de defesa contra infecção intracelular; sistemas de citotoxicidade celular. Tolerância imunológica: mecanismo de deleção clonal, tolerância periférica e anergia, apoptosis, mecanismos alternativos de supressão, network, etc. Mecanismo imunológicos em processos patológicos. Autoimunidade: doenças autoimunes; modelos experimentais; perspectivas de intervenção terapêutica. Alergia e inflamação: reações de hipersensibilidade, IgG, mediadores, complemento. Mecanismos imunológicos de defesa à doenças infecciosas e vacinação, Influenza (vírus), tuberculose/lepra (mycobacteria). Imunologia do cãncer e imunoterapia.

INFORMAÇÃO CIENTÍFICA - 15 horas
Coordenador Científico do IBCCF

Ementa: Conferências sobre diferentes tópicos de Biofísica e assuntos correlatos.

INTRODUÇÃO À NEUROBIOLOGIA DO DESENVOLVIMENTO - 45 horas
Leny Alves Cavalcante

Ementa: Eventos iniciais na formação do sistema nervoso dos vertebrados. Comunicação intercelular na neuroectoderma. Neurulação I, Neurulação II. Proliferação celular e expressão fenotípica no reuroepitélio. A crista neural. Migração neuronal no sistema nervoso periférico e central. Crescimento do axônio. Dendritogênese e sinaptogênese. Interação neurônio-glia em diversos períodos ontogênicos.

INTRODUÇÃO A RESSONÂNCIA MAGNÉTICA NUCLEAR DE IMAGEM - 30 horas
Ronaldo da Silva Mohana Borges

Ementa: Introdução à técnica de RMN aplicada à imagem, aplicações clínicas das sequências de pulso de RMN, aplicações clínicas das sequências de pulso de RMN; artefatos que influenciam a imagem de RMN; fundamentos de imagem avançada em RMN, considerações sobre bioefeito e segurança da RMN; meios de contraste em RMN.

INTRODUÇÃO A RESSONÂNCIA MAGNÉTICA NUCLEAR MULTIDISCIPLINAR DE MACROMOLÉCULAS - 75 horas
Ronaldo da Silva Mohana Borges

Ementa: Princípios básicos clássicos de ressonância magnética nuclear (RMN); descrição teórica de RMN; sistemas multi-spins; RMN uni, bi e multidimensional; relação e processos dinâmicos; aspectos experimentais de RMN; experimentos de RMN heteronucleares; assinalamento sequencial e cálculo de estruturas de macromoléculas (proteínas, DNA e carbohidratos).

MECANISMO DE PROCESSAMENTO ANTIGÊNICO - 30 horas
Julio Scharfstein

Ementa: Através de discussões de artigos científicos originais, pretende-se reconstruir o percurso interdisciplinar (imunologia, bioquímica e biologia celular) que conduziu ao conhecimento sobre mecanismos de processamento e apresentação antigênica. Na primeira parte, pretende-se revisar conhecimentos sobre os tópicos de bioquímica e biologia celular pertinentes ao assunto (biogênese de lisosomas e de outros compartimentos da via secretória, glicosilação e outras modificações pós-traducionais de proteínas, natureza e função de chaperoninas, proteinases lisosomais e citosólicas). Neste amplo contexto, pretende-se focalizar o debate sobre aspectos diretamente relacionados com apresentação antigênica, à saber: descrição das vias de apresentação, relações estrutura-função das moléculas MHC, influência sobre a geração de repertório, controle genético da resposta imune, implicações para estratégias de vacinação e em fenômenos de auto-imunidade.

MEDIADORES LIPIDICOS EM INFLAMAÇÃO E CÂNCER - 60 horas
Bruno Lourenço Diaz, Christianne Bandeira de Melo

Ementa: O curso abordará os aspectos da produção e ação de medidores lipídicos com ênfase nos derivados de ácido araquidônico, em processos de base inflamatória como: câncer; alergia; aterosclerose; e infecções. Os alunos deverão apresentar seminário sobre os mais recentes avanços dos estudos de mediadores lipídicos e as potenciais implicações para seus próprios projetos de tese. OS assuntos abordados incluem: Fosfolipases A2; Lipoxigenases, ciclooxigenases; outras enzimas metabolizadoras do ácido araquidônico; sítios intracelulares de metabolização do ácido araquidônico; PAF; síntese, metabolismo, receptores, vias de sinalização; ligantes de receptores nucleares, lipoxinas; receptores, vias de sinalização e função; leucotrienos; receptores, vias de sinalização e função; prostanóides, receptores, vias de sinalização e função; patogênese da resposta inata; patogênese da asma; patogênese da aterosclerose; patogênese do câncer.

MÉTODOS DE FÍSICA MOLECULAR E ESPECTROSCOPIA - 120 horas
Paulo Mascarello Bisch, Pedro Geraldo Pascutti

Ementa: 

1. Mecânica Quântica: fundamentos da física moderna; funções de onda, interpretação de Born e princípio da incerteza; partícula em uma caixa uni-dimensional: espectro discreto; movimentos vibracionais e rotacionais.
2. Estrutura Atômica e Molecular: o átomo de hidrogênio: espectros, funções de distribuição radial; átomos multieletrônicos; teoria de ligação de valência; teoria do orbital molecular.
3. Propriedades Elétricas e Magnéticas da Matéria: isolantes, condutores e semicondutores; dipolos elétricos e interações intermoleculares; propriedades magnéticas.
4. Espectroscopia: espectroscopia Raman; fluorescência e fosforescência; lasers e aplicações; ressonância magnética.

MICROSCOPIA ELETRÔNICA DE TRANSMISSÃO - 60 horas
Kildare Rocha de Miranda

Ementa: Princípios de funcionamento do microscópio eletrônico de transmissão. Processamento de amostras; fixadores, tampões, desidratação, emblocamento, ultramicrotomia, contrastação positiva. Citoquímica de enzimas, citoquímicas de carbioidratos. Imunocitoquímica, reconstrução 3D, tomografia, criotécnicas.

MICROSCOPIA ELETRONICA DE VARREDURA - 30 horas
Marcia Attias

Ementa: Princípios de funcionamento do microscópio de varredura. Formação da imagem. Processamento de amostras, fixação química, desidratação, secagem e metalização. Métodos especiais, biossegurança.

MICROSCOPIA OPTICA - 30 horas
Marcos Farina de Souza

Ementa: 

Teórica: difração, figura de Airy, resolução, formação da imagem, olho, lupa, microscópio, iluminação de Kohler, objetivas, oculares, condensadores, fontes luminosas, filtros, fotografia em microscopia óptica, contraste de fase, polarização e contraste interferência e fluorescência.

Prática: uso correto de microscópio, Kohler, diafragmas de campo e de abertura, imersão, fotomicrografia,  micrometria, fluoromicroscopia e polarização. Video microscopia e processamento de imagens.

 

MODIFICAÇÃO PÓS-TRADUCIONAL - 45 horas
Wagner Barbosa Dias

Ementa: Modificação pós-traducional (MPT) é qualquer modificação química que ocorre na proteína após sua tradução. Apesar do projeto genoma humano ter revelado a presença de apenas 25.000 genes, estudos atuais acreditam que o número de diferentes proteínas encontradas no nosso organismo passe facilmente de 1.000.000 em virtude das MPTs. Em adição, já se sabe que essas MPTs governam o tráfego, degradação, atividade e função molecular. Essa disciplina abrange as principais modificações pós-traducionais, focalizando principalmente nos diferentes tipos de glicosilação, fosforilação, ubiquitinação, âncora GPI e proteólise. Os alunos terão que apresentar um seminário mostrando a importância da MOT abordada no estudo e entregar um estudo dirigido conceituando brevemente a MPT escolhida.

NEUROBIOLOGIA CELULAR, MOLECULAR E DO DESENVOLVIMENTO - 30 horas
Rosália Mendez Otero

Ementa: Organização celular do sistema nervoso e relação com função. Aspectos moleculares do desenvolvimento neural. Expressão gênica em neurônios e glia. Aspectos moleculares das interações neurônio-glia. Migração neural e crescimento axonal. Papel da matriz extracelular no sistema nervoso central e periférico. Estabelecimento de conexões.

NEUROBIOLOGIA DA GLIA - 45 horas
Silvana Allodi

Ementa: As células da glia, que já foram consideradas meros coadjuvantes dos neurônios, estão cada vez mais atraindo a atenção de neurocientistas, o que tem gerado crescente produção de importantes informações a seu respeito. Para entender melhor seu papel, no curso serão estudados tópicos como: a morfologia dos diversos tipos de células da glia de vertebrados, seu desenvolvimento, a fisiologia geral destas células e suas interações com os neurônios. Para compreensão das origens evolutivas da glia, serão estudadas também aspectos diversos das células da glia de invertebrados. Finalmente, serão abordados o papel da glia no funcionamento do sistema nervoso e alguns aspectos patológicos do sistema nervoso que envolvem estas células.  

NEUROTRANSMISSORES E PLASTICIDADE SINÁPTICA - 45 horas
Ricardo Augusto de Melo Reis

Ementa: Introdução ao Curso: Neurônio e glia, SNP e SNC; Estrutura e Função SN; Sinalização Elétrica e Química; Propriedades e Características das Sinapses; Receptores Neurotransmissores; Respostas Comportamentais – dos canais iônicos às populações neuronais; Desenvolvimento do SNC: Papel de Neurotransmissores na Gênese, Proliferação e Migração Neuronal; Alterações biológicas e desordens; Fatores Tróficos e Apoptose, Transdução de Sinal. Sinalização e Respostas gênicas Plasticidade Neuronal:Módulos Cerebrais: localização e função; Períodos Críticos – O que nos faz humanos, Linguagem, Ritmos Biológicos e Genes; Neurotransmissores e Patologias Cerebrais Sinapse Colinérgica: Receptores Muscarínicos e Nicotínicos; Sinapse Neuromuscular como modelo; Terminal Pré- e Pós-Sináptico; Animais transgênicos e Knock-outs Sinapse Glutamatérgica Excitabilidade; despolarização, Receptores e Sinalização, Animais knockout e transgênicos; Memória e Aprendizagem, LTP e LTD, Excitotoxicidade Neuronal.; Alzheimer, Esclerose, Isquemia Sinapse Gabaérgica Inibição e Depressão; Receptores e Sinalização Gabaérgica, Animais knockout e transgênicos; Alcoolismo, Ansiedade e Epilepsia Sinapse Serotoninérgica, modulações Comportamentais, Receptores e Sinalização, Diversidade de Respostas Ansiedade e Depressão, Alucinação; Ações hipotalâmicas e mesencefálicas no controle da fome (Obesidade) e do Sexo (Compulsão) Sinapse Catecolaminérgica, Vias dopaminérgicas, noradrenérgicas e Adrenérgicas: receptores e sinalização. Dependência de drogas e a cocaína, Sistemas de motivação e recompensa, Parkinson e os gânglios da base Sinapses Peptidérgicas: tipos e Propriedades; Alças regulatórias Neurotransmissores não convencionais: Gases, metais e lipídeos. Outras Sinapses: gases,  metais e lipídeos como neurotransmissores e  neuromoduladores. Sistema Límbico e o cérebro emocional, Amigdala, Hipocampo, Hipotálamo e o SNA, Memória explícita e implícita, Emoção, Cognição e Comportamento, Psicologia evolutiva, Plasticidade Cerebral, Considerações Finais.

O NASCIMENTO DO PENSAMENTO OCIDENTAL - 30 horas
Maria Cristina Machado Motta

Ementa: O Espanto como princípio da filosofia. As questões de criança e as grandes áreas da filosofia. Linha cronológica dos principais pensadores; 2) Hesíodo, A Teogonia e as primeiras cosmologias míticas. 3) O mundo Mítico: Homero, Ilíada. O Herói, a Honra e a cultura da Vergonha. Arete, excelência, Hybris, desmedida. Os deuses humanos e os homens divinos; 4) O mundo Mítico: Homero, Odisséia. O nostos (retorno) do Herói, o mundo dos mortos, a alma e a questão do sujeito da Grécia arcaica; 5) Os primeiros filósofos, chamados pré-socráticos: Tales, Anaxímenes, Anaximandro (os jônicos), Leucipo e Demócrito (os atomistas). Os elementos, “Tudo é um”, Substância e a interpretação de Aristóteles; 6) Os Eleatas: Pitágoras e os números. Parmênides e o radicalismo do monismo eleata. Zenão e Melisso. Heráclito e o mobilismo. 7) Sócrates, os sofistas e a arte do bem falar da Ágora: Górgias e Protágoras. 8) Platão e os diálogos. Os diálogos iniciais e as aporias. Os diálogos da maturidade, a República e as três imagens centrais: o sol, a linha dividida e a caverna. 9) Aristóteles e a metafísica da Substância (ousia). As quatro causas, Ato e potência. 

PENSE E DANCE: A FILOSOFIA DO DESENHO EXPERIMENTAL - 60 horas
Mauro de Freitas Rebelo

Ementa: Lógica dedutiva e indutiva, método científico, hipótese nula, medidas de tendência central e dispersão, probabilidade e testes de hipótese, conceitos de resolução e número amostral, criatividade, desenho experimental.

PESQUISA DE DISSERTAÇÃO (M) - 0 horas
Orientador(a)

Ementa: Estágio no laboratório para a realização da parte experimental da dissertação de mestrado.

PESQUISA DE TESE (D) - 0 horas
Orientador(a)

Ementa: Estágio no laboratório para a realização da parte experimental da Tese de Doutorado.

PRÊMIO NOBEL: LIÇÕES SOBRE IMUNOLOGIA - 30 horas
Julio Scharfstein

Ementa: Tendo como referência a biografia dos imunologistas laureados com Prêmio Nobel nos últimos 100 anos, os professores vinculados ao programa de PG descreverão o contexto em que se produziram estas extraordinárias, colocando em perspectiva sua relevância para o avanço do conhecimento sobre a função do sistema imunitário. Bibliografia: http://noelprize.org/

PROPRIEDADE INTELECTUAL - 30 horas
Eleonora Kurtenbach

Ementa: Esse curso é destinado a alunos de pós-graduação que pesquisam no campo da biotecnologia/nanotecnologia e que desenvolvem projeto de pesquisa com potencial de gerar produtos/processos patenteáveis.  O objetivo central é de motivar o aluno a proteger o conhecimento gerado na universidade quando esse apresentar aplicação industrial.  Para tanto esse curso é composto por aulas práticas online, onde o aluno é orientado a realizar uma busca de anterioridade sobre um tema do seu interesse e avaliar se o objeto a ser protegido atende aos requisitos e condições de patenteabilidade. Em seguida o aluno é motivado a redigir o seu próprio pedido de patente e a optar pela via de depósito a ser seguida. Paralelamente, aulas teóricas especialmente preparadas para esse público alvo, transmitem noções básicas sobre a propriedade intelectual/industrial.

PUBLICAÇÃO DE ARTIGO CIENTÍFICO I - 75 horas
Orientador(a)

Ementa: Publicação de artigo científico completo em revista indexada com índice de impacto igual ou superior a qualis A no qual o aluno seja primeiro autor.

PUBLICAÇÃO DE ARTIGO CIENTIFICO II - 75 horas
Orientador(a)

Ementa: Publicação de artigo científico completo em revista indexada com índice de impacto igual ou superior a qualis A no qual o aluno seja primeiro autor.

RADIO E FOTOBIOLOGIA - 90 horas
Alvaro Augusto Costa Leitão

Ementa: Interação das radiações com a matéria. Origem das lesões induzidas pelas radiações e pelos agentes químicos. Radioquímica e fotoquímica de ácidos nucléicos. Medidas da inativação em diferentes níveis de organização biológica. Fatores que modificam a sensibilidade às radiações ionizantes. Mecanismos celulares de reparação. Efeitos somáticos das radiações ionizantes e não ionizantes.

SEMINÁRIOS DE BIOLOGIA CELULAR - 30 horas
Marcia Attias, Maria Cristina Machado Motta, Narcisa Leal da Cunha e Silva, Sonia Rozental, Wanderley de Souza

Ementa: Apresentação e discussão de trabalhos publicados e em andamento na área de Biologia Celular, enfatizando resultados inovadores e novas abordagens metodológicas.

 

SEMINÁRIOS DE GLICOBIOLOGIA - 30 horas
Wagner Barbosa Dias

Ementa: A disciplina abrange todas as sub-areas da Glicobiologia, focalizando nos trabalhos científicos recentes de alto nível. Os trabalhos geralmente são retirados das revistas Glycobiology, Journal of Biological Chemistry, Science, Nature, Biochemistry, Biochemical Journal, Cellular Microbiology, Cancer, Oncogene entre outras. Os principais temas abordados são: metabolismo de açúcares, biossintese de glicanas, interação parasita-hospedeiro, glicobiologia do câncer, O-GlcNAc, lectinas, importância do ácido siálico, caracterização estrutural de glicanas, relacionar estrutura e função biológica de glicoconjugados no sistema imune.

SEMINÁRIOS DE IMUNOLOGIA - 30 horas
Todos os docentes do Programa

Ementa: Os seminários constam de apresentação de artigos, resultados experimentais dos trabalhos em andamento no laboratório, e conferências eventuais de pesquisadores convidados. Todos os participantes fazem apresentações periódicas de artigos. Os temas abordados são de natureza diversa, mas especial atenção é dada a: temas gerais de imunologia; temas gerais de biofísica molecular e celular; canais iônicos no sistema imune; citotoxicidade mediada por linfócitos (abordagem molecular e celular); macrófagos; AIDS e imunoparasitologia.

SEMINÁRIOS DE NEUROGÊNESE - 30 horas
Rafael Linden

Ementa: Tópicos de desenvolvimento do sistema nervoso, aspectos celulares e moleculares, em particular regulação de populações neuronais, interações tróficas, fatores neurotróficos, fenômenos regressivos, apoptose. O curso será baseado em seminários duas vezes por semana (terças e quintas), ao meio-dia, apresentados em sistema de rodízio pelos alunos inscritos e demais participantes.

SEMINÁRIOS DE PROTOZOOLOGIA - 30 horas
Rossiane Claudia Vommaro, Técia Maria Ulisses de Carvalho, Wanderley de Souza

Ementa: Apresentação e discussão de trabalhos publicados ou em realização na área. Conferências a serem ministradas por pesquisadores de outras instituições que atuam na área de Protozoologia.

SEMINÁRIOS DO LABORATÓRIO DE BIOLOGIA MOLECULAR E BIOQUIMICA DE PROTEINAS - 30 horas
Eleonora Kurtenbach

Ementa: Serão discutidos os resultados obtidos nas teses dos alunos de pós-graduação e nos projetos de Iniciação Científica. Também serão abordados artigos recentes relacionados às quatro linhas de pesquisa do laboratório (caracterização das defensinas Psd1 e Psd2 da ervilha P. sativum, investigação das vias de sinalização e análise estrutural e funcional de proteínas desconhecidas envolvidas na resposta da levedura S. cerevistae a estresses, modelos experimentais de cardiopatia dilatada bem como publicações sobre temas atuais de grande impacto na comunidade científica internacional.

SEMINÁRIOS EM BIOFÍSICA AMBIENTAL - 30 horas
João Paulo Machado Torres

Ementa: Caracterização de fontes; processos de amostragem; físico-química ambiental de metais pesados e substâncias orgânicas; métodos de medida; cadeias tróficas. Toxicologia ambiental; traçadores radioativos.

SEMINÁRIOS EM BIOLOGIA E BIOQUÍMICA DE INSETOS - 30 horas
Ednildo de Alcântara Machado

Ementa: Aspectos da fisiologia dos insetos, principalmente associados ao sistema reprodutivo e digestivo, tais como: Aspectos comportamentais da cópula e oviposição de insetos; glândulas acessórias do sistema reprodutivo e suas secreções durante a oviposição; hormônios e transdução de sinal no controle da formação de ovos nos insetos; interação vírus-receptor em trato digestivo e reprodutivo de insetos; receptores de hormônios e proteínas de vitelo no trato reprodutivo de insetos; diversos aspectos da interação parasito-vetor no trato digestivo de insetos.

SEMINÁRIOS EM IMUNOBIOFÍSICA - 30 horas
Pedro Muanis Persechini

Ementa: O curso consiste de reuniões semanais com duração de 60 a 90 min onde são apresentados e discutidos artigos atuais em imunologia e imunobiofísica e experimentos em andamento. Cada reunião é conduzida, em sistema de rodízio, por um dos alunos inscritos. Eventualmente contamos com a participação de conferencistas convidados. Os temas principais são: receptores de nucleotídeos (P2), mecanismos de citotoxicidade, canais iônicos e transdução de sinal em células do sistema imune, especialmente macrófagos e linfócitos citotóxicos.

SEMINÁRIOS EM NEUROBIOLOGIA - 30 horas
Coordenador do P.A.Neurociências

Ementa: Organização morfo-funcional do sistema visual. Neurobiologia e psicofísica visual, depressão alastrante, desenvolvimento e plasticidade do sistema nervoso.

SEMINÁRIOS EM RADIO E FOTOBIOLOGIA - 30 horas
Alvaro Augusto Costa Leitão

Ementa: Efeitos biológicos das radiações ionizantes e não ionizantes em todos os níveis de organização biológica. Processos de reparação em células procarióticas e eucarióticas.  Mutagênese e genotoxicidade; detecção e caracterização dos mecanismos moleculares dos agentes genotóxicos.  Interação das radiações entre si e com outros agentes físicos e químicos. Radioterapia e fototerapia. Patologias relacionadas a deficiência em sistemas de reparação.

SEMINÁRIOS EM TERAPIAS CELULARES - 30 horas
Rosália Mendez Otero

Ementa: Biologia das células tronco: aspectos gerais, aspectos éticos e legais. Diferentes tipos de células tronco: embrionárias, germinativas, fetais, adultas. Células tronco hematopoiéticos e mesenqumais. Características morfo-funcionais dos diferentes tipos de células tronco. Isolamento, cultivo e características fenotípicas dos diferentes tipos de células tronco. Células tronco no indivíduo adulto. Estudos em modelos animais de terapias celulares. Localização do “homing” das células tronco através da marcação com radiofármaco. Estudos clínicos. Protocolos em andamento e em discussão.

SINALIZAÇÃO NA RESPOSTA AO DANO DE DNA - 30 horas
Francisco Meirelles Bastos de Oliveira

Ementa: A disciplina tem por objetivo oferecer uma perspectiva histórica sobre a pesquisa desenvolvida na área de sinalização de dano ao DNA, com enfoque nas principais doenças/síndromes associadas à instabilidade genômica. A disciplina consiste em aulas expositivas sobre os mecanismos de  sinalização de dano de DNA, seguidas por apresentações e discussões de artigos históricos referentes ao tema.

SISTEMAS SENSORIAIS DE VERTEBRADOS E INVERTEBRADOS - 30 horas
Silvana Allodi

Ementa: Estrutura macroscópica, microscópica e subcelular dos sistemas somestésico, visual, auditório, gustatório e olfatório, tanto de vertebrados como de invertebrados. Também se estudam aspectos fisiológicos destes sistemas. Metodologia: aulas teóricas expositivas ministradas pela professora e seminários apresentados pelos alunos.

TÉCNICAS DE ESPALHAMENTO DE LUZ - 30 horas
Susana Frases Carvajal

Ementa: Aulas teóricas e discussão de trabalhos abordando: conceitos teóricos sobre os princípios do espalhamento de luz. Bases teóricas das técnicas de espalhamento de luz dinâmico e estático. Conceitos teóricos do potencial Zeta. Preparação de amostras. Aplicações das técnicas de espalhamento de luz na Nanotecnologia, Biologia e Biomedicina. Lipossomos: Estudos de caracterização e estabilidade. Caracterização de anticorpos: Estudos de interações Antígeno-Anticorpo. Caracterização de nanocristais de celulose formados a partir de papel reciclado. Aplicação na indústria cosmética e farmacêutica. Caracterização de ouro coloidal. Caracterização de moléculas de DNA. Caracterização de proteínas: Determinação de pontos isoelétricos, predição das constantes de equilíbrio.Caracterização de polímeros. Caracterização dos polissacarídeos capsulares de Cryptococcus neoformans e C. gattii.

TOPICOS AVANÇADOS EM DESENVOLVIMENTO E TUMORAL DO SNC - 30 horas
Rodrigo Alves Portela Martins

Ementa: Conceitos fundamentais de eventos fisiológicos do desenvolvimento e fisiopatológicos da tumorigênese do sistema nervoso central serão abordados através da apresentação por parte dos alunos de estudos clássicos e publicações recentes de grande relevância nessa área de conhecimento.

TOPICOS AVANÇADOS EM DINÂMICA MOLECULAR - 60 horas
Pedro Geraldo Pascutti

Ementa: Tópicos em Mecânica e Dinâmica Molecular, uso de termostatos e barostatos, tratamentos eletrostáticos pelos métodos Soma de Ewald e Campo de Reação. Métodos de paralelização e uso de GPU (unidade de processamento gráfico) em simulações de proteínas e biomembranas. Parametrização de fármacos empregando métodos de Mecânica Quântica. Protocolos de simulação. Desenvolvimento de scripts para tratamento de dados em linguagens Shell, Awk e TCL. Análise de resultados: cálculo de desvios e flutuações conformacionais, estabilidade de estruturas secundárias e ligações hidrogênio, análise de componentes principais de movimentos, oscilações de em larga escala, análises gráficas, elaboração de animações. Introdução aos métodos híbridos QM/MM (Mecânica quântica/mecânica molecular). “Steered molecular dynamics” e “coarse grained”. Introdução ao cálculo de energia livre.

TÓPICOS EM NEUROBIOLOGIA DA RETINA - 30 horas
Fernando Garcia de Mello, Patricia Franca Gardino, Rafael Linden, Ricardo Augusto de Melo Reis

Ementa: Seminários com os trabalhos que estão sendo desenvolvidos nos laboratórios de Neurogênese, Neurobiologia da Retina e Neuroquímica e trabalhos da literatura.

TÓPICOS EM NEURODEGENERAÇAO - 90 horas
Rafael Linden

Ementa: Ciclo celular e degeneração; morte celular programada no sistema nervoso e outros sistemas biológicos; formas de degeneração celular; apoptose e necrose; mecanismos de degeneração celular; segundos mensageiros envolvidos em degeneração celular; genes e proteínas "killer" e protetoras; fatores neurotróficos; neurotoxicidade; biologia celular e molecular de doenças neurodegenerativas.

TÓPICOS ESPECIAIS EM BIOFÍSICA I - 15 horas
Coordenação de PG

Ementa: Tópicos atuais em Biofísica 

TÓPICOS ESPECIAIS EM BIOFÍSICA II - 30 horas
Coordenação de PG

Ementa: Tópicos atuais em Biofísica

TRÁFEGO INTRACELULAR DE VESÍCULAS - 45 horas
Narcisa Leal da Cunha e Silva

Ementa: Aulas teóricas e discussão de trabalhos abordando. O complexo de Golgi; exocitose constitutiva e exocitose regulada; a via endocítica; revestimentos vesiculares; o citoesqueleto e tráfego vesicular; identidade dos compartimentos intracelulares; fusão de membrana; reconstituição in vitro do tráfego vesicular.

VIROLOGIA SEM MISTÉRIOS - 60 horas
Clarissa Rosa de Almeida Damaso

Ementa: Aspectos moleculares da replicação dos vírus. Sistemas enzimáticos envolvidos na replicação. Síntese de macromoléculas em células infectadas. Substâncias anti-virais.